Le fort est construit sur un banc de sable nommé « longe de Boyard » qui a donné son nom au fort.
De forme oblongue, le fort mesure 68 mètres de long dans l'axe sur 31 mètres de large, pour une superficie au sol de 2 065 m² et totale de 2 689 m². La cour intérieure mesure 43 m de long dans l'axe, 12 m de large et sa surface est de 565 m². Les murs d'enceinte culminent à 20 mètres depuis les fondations. Il est visible depuis Fouras et bien sûr de la côte ouest de l'Île d'Aix, où de nombreux touristes viennent en été voir le fort de plus près.
Situé à égale distance entre les îles d'Aix et Oléron et Fouras, ce vaisseau de pierre a été construit pour protéger le Pertuis d'Antioche et l'arsenal maritime de Rochefort car à l'époque le tir des boulets était insuffisant.
Le Fort Boyard était donc le relais permettant de croiser le tir des batteries des deux îles. Le fort ne sera néanmoins jamais utilisé pour sa fonction initiale puisque l'artillerie va faire d'énormes progrès durant le construction difficile de Fort Boyard.